Храм Святого Иоанна Предтечи в городе Керчь является одним из уникальнейших памятников византийского зодчества, который был воздвигнут в VIII веке и по древности уступает лишь  Церкви  Святого Иоанна Златоуста, находится в Команах, Абхазия.

Подтверждением этого факта служит и надпись, сделанная на одной из колонн, поддерживающей свод Церкви и датируемая 752 годом от Рождества Христова. Кроме того, в кладке камня были обнаружены и греческие амфоры 8-9 века. Восточная часть Храма возведена из белого камня и плинфы (плоский кирпич). Чередуясь между собой, они образовывают  характерную для византийских построек бело – розовую кладку. Такой прием в строительстве, кроме художественной привлекательности имеет и еще одно назначение – антисейсмическое.

Рождение Иоанна Предтечи, в честь которого названа эта Церковь, было предсказано самим Архангелом Гавриилом. Во время гонения царя Ирода на младенцев, Праведная Елизавета, родительница Святого Иоанна скрылась с ребенком в пустыне, а Его отец — Захария, отказался открыть воинам царя их местопребывание, за что и был убит. В дальнейшем, находясь длительное время в пустыне, Святой Иоанн готовил себя к  служению Господу посредством строжайшего поста и непрерывной молитвы. После того, как  Ему был явлен глас Божий, он пришел к людям, начав проповедовать о приходе Спасителя. Святой Иоанн крестил людей на реке Иордан, а позднее от него принял крещение и сам Иисус Христос.

Не далеко от церкви и до наших дней сохранилась плита с углублением, которое по форме напоминает человеческий след. По преданию, это след самого Иоанну Крестителю. В эпоху Крымского ханства, многие из православных Храмов, были обращены в мусульманские мечети. Участь это не миновала и Церковь Святого Иоанна. После того, как Керчь стала частью Российской империи, а это произошло в 1774 году, Храм Иоанна Предтечи вновь стал православной Святыней. В 19 веке, появилось и название Храма, которое сохранилось до сегодняшнего дня — «Храм усекновения главы Иоанна Предтечи».

В 1845 году к основному зданию Храма были пристроены двухъярусная колокольня и северный притвор. Во время проведения реконструкции Храма, в начале 19 века, были обнаружены две фрески, с изображением Святых. Предполагают, что эти фрески являются  творением учеников Феофана Грека.

Через 100 лет, во время печально известной борьбы большевиков с религией и верой, Храм был закрыт, как значилось в документах, «в связи с отсутствием прихода». И только в 1957 году о нем вспомнили, как о памятнике византийской архитектуры. В то время, вокруг упраздненной Церкви, являющей собой печальное зрелище из – за выбитых окон, кустарника, выросшего на стенах и крыше, общего полуразрушенного состояния, раскинулся рынок, где многочисленные торговцы предлагали свой товар – жирных бычков, черноморскую кильку, барабульку и осетров.

В 1963 году Храм получил статус «памятника архитектуры», позднее началась и его реставрация. Изначально были отреставрированы стены пристроек и колокольни. Художники старались заменять лишь полностью разрушенные детали. Реставраторам пришлось проделать колоссальную работу – изучить образцы черепицы и плинфы, с целью изготовить подобные. Был подобран и такой же камень – известняк, из которого больше, чем 10 столетий назад был возведен Храм. Художники осуществили действия направленные на закрепление росписи Храма и остатков древней штукатурки. Несмотря на отсутствие официального разрешения властей, на куполе Храма все же был закреплен крест. А в июне 1990 года церковь была передана в управление керченскому православному сообществу. Сегодня – Храм действующий, и в нем постоянно совершаются богослужения.